| Группа A| 1 | Суонси | 2 | 6 | | 2 | Санкт-Галлен | 2 | 3 | | 3 | Валенсия | 2 | 3 | | 4 | Кубань | 2 | 0 |
Группа B| 1 | Лудогорец | 2 | 6 | | 2 | ПСВ | 2 | 3 | | 3 | Черноморец | 2 | 3 | | 4 | Динамо З | 2 | 0 |
Группа C| 1 | Зальцбург | 2 | 6 | | 2 | Эсбьерг | 2 | 3 | | 3 | Стандард | 2 | 1 | | 4 | Эльфсборг | 2 | 1 |
Группа D| 1 | Рубин | 2 | 6 | | 2 | Уиган | 2 | 4 | | 3 | Зюлте-Варегем | 2 | 1 | | 4 | Марибор | 2 | 0 |
Группа E| 1 | Фиорентина | 2 | 6 | | 2 | Днепр | 2 | 3 | | 3 | Пандурий | 2 | 1 | | 4 | Пасуш-де-Феррейра | 2 | 1 |
Группа F| 1 | Айнтрахт Ф | 2 | 6 | | 2 | Маккаби Т-А | 2 | 4 | | 3 | АПОЕЛ | 2 | 1 | | 4 | Бордо | 2 | 0 |
| Группа G| 1 | Генк | 2 | 6 | | 2 | Тун | 2 | 3 | | 3 | Динамо К | 2 | 1 | | 4 | Рапид В | 2 | 1 |
Группа H| 1 | Севилья | 2 | 6 | | 2 | Слован | 2 | 4 | | 3 | Фрайбург | 2 | 1 | | 4 | Эшторил | 2 | 0 |
Группа I| 1 | Витория | 2 | 4 | | 2 | Бетис | 2 | 2 | | 3 | Лион | 2 | 2 | | 4 | Риека | 2 | 1 |
Группа J| 1 | Лацио | 2 | 4 | | 2 | Трабзонспор | 2 | 4 | | 3 | Аполлон | 2 | 3 | | 4 | Легия | 2 | 0 |
Группа K| 1 | Тоттенхэм | 2 | 6 | | 2 | Шериф | 2 | 2 | | 3 | Анжи | 2 | 1 | | 4 | Тромсе | 2 | 1 |
Группа L| 1 | ПАОК | 2 | 4 | | 2 | АЗ | 2 | 4 | | 3 | Маккаби Х | 2 | 1 | | 4 | Шахтер Кг | 2 | 1 |
|
